Родился в 1635 году в Шпейере. Занимался самообразованием, получил серьезные познания в различных областях науки, стал врачом. В 1666 году был назначен профессором медицины в Майнце и одновременно получил должность лейб-медика майнцского курфюрста. Вскоре стал лейб-медиком баварского курфюрста, затем переселился в Вену и поступил на придворную службу. В 1678 году переехал в Голландию, затем в Англию. Бехер имел склонность к фантастическим проектам, которые предлагал различным высокопоставленным лицам. В 1666 году он разработал проект строительства канала Рейн-Дунай для развития торговли с Нижними странами, а в 1678 году предложил организовать в грандиозном масштабе переработку песка в золото. Занимался горным делом и пытался внести усовершенствования в способы добычи горных руд.В своих ранних сочинениях Бехер предстает как последователь алхимического учения о трех началах, из которых состоят все тела. В дальнейшем в сочинении, написанном в мюнхенский период жизни и вышедшем в 1669 под названием Подземная физика' ('Physicae Subterraneae'), высказал мысль, что все минеральные тела (в частности, металлы) состоят из трех 'земель': стеклующейся (terra lapidea)
