Наиболее значительное произведение Вячеслава Шишкова - историческая эпопея Емельян Пугачев'. Она была написана в период с 1938 по 1945 годы. Книга, основанная на многолетнем изучении исторических документов, явилась крупным вкладом в развитии советского исторического жанра и была удостоена в 1946 году Государственной премии СССР.'